Akcja moda dzieje się kilka miesięcy po wypłynięciu Bezimiennego na Dwór Irdorath. Khorinis zostaje najechane i zdobyte przez orków, a garstce mieszkańców, dzięki pomocy magów ognia udaje się ewakuować i opuścić zagrożone tereny. Pod wodzą Pyrokara ocalali wyruszają do Górniczej Doliny, celem osiedlenia się w bezpiecznym miejscu. Ostatecznie rozbijają obóz w Górskiej Fortecy. Ze względów bezpieczeństwa Magowie wywołują trzęsienie ziemi na przełęczy, odcinając dolinę od świata zewnętrznego. By odizolować się od orków wysadzają także most, prowadzący do fortecy. Podczas rozgrywki wcielamy się w Jergana – byłego zwiadowcę Garonda, który zostaje odnaleziony w dolinie i przetransportowany do fortecy. Jego stan jest ciężki, jednak dzięki pomocy magów udaje się wybudzić go ze śpiączki. Po odzyskaniu sił Jergan postanawia opuścić wyspę Khorinis i wrócić do rodziny – na Kontynent.